Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIBP2Q8ND30 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP2Q8ND30 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms