Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BBOF1Q8ND07 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BBOF1Q8ND07 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBOF1Q8ND07 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms