Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C3

TRIML2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML2, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML2Q8N7C3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIML2Q8N7C3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIML2Q8N7C3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1101.7 ms