Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM20Q8N5G0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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