Protein–RNA interactions for Protein: Q8N114

SHISA5, Protein shisa-5, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA5Q8N114 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHISA5Q8N114 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHISA5Q8N114 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SHISA5Q8N114 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHISA5Q8N114 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHISA5Q8N114 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHISA5Q8N114 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHISA5Q8N114 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SHISA5Q8N114 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SHISA5Q8N114 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHISA5Q8N114 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHISA5Q8N114 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHISA5Q8N114 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SHISA5Q8N114 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SHISA5Q8N114 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHISA5Q8N114 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SHISA5Q8N114 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SHISA5Q8N114 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SHISA5Q8N114 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms