Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT6

LRRC8A, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8AQ8IWT6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC8AQ8IWT6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC8AQ8IWT6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRC8AQ8IWT6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC8AQ8IWT6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC8AQ8IWT6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms