Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RPAINQ86UA6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPAINQ86UA6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPAINQ86UA6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
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