Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA2D4Q7Z3S7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA2D4Q7Z3S7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms