Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
PTF1AQ7RTS3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTF1AQ7RTS3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTF1AQ7RTS3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTF1AQ7RTS3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTF1AQ7RTS3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTF1AQ7RTS3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTF1AQ7RTS3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTF1AQ7RTS3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTF1AQ7RTS3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTF1AQ7RTS3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTF1AQ7RTS3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTF1AQ7RTS3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PTF1AQ7RTS3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTF1AQ7RTS3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTF1AQ7RTS3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTF1AQ7RTS3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTF1AQ7RTS3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTF1AQ7RTS3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTF1AQ7RTS3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTF1AQ7RTS3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTF1AQ7RTS3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTF1AQ7RTS3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTF1AQ7RTS3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTF1AQ7RTS3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTF1AQ7RTS3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTF1AQ7RTS3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTF1AQ7RTS3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTF1AQ7RTS3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTF1AQ7RTS3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTF1AQ7RTS3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTF1AQ7RTS3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTF1AQ7RTS3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTF1AQ7RTS3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
PTF1AQ7RTS3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTF1AQ7RTS3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTF1AQ7RTS3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTF1AQ7RTS3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTF1AQ7RTS3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTF1AQ7RTS3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTF1AQ7RTS3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
PTF1AQ7RTS3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTF1AQ7RTS3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTF1AQ7RTS3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTF1AQ7RTS3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTF1AQ7RTS3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTF1AQ7RTS3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTF1AQ7RTS3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTF1AQ7RTS3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTF1AQ7RTS3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTF1AQ7RTS3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PTF1AQ7RTS3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTF1AQ7RTS3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PTF1AQ7RTS3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTF1AQ7RTS3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTF1AQ7RTS3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTF1AQ7RTS3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTF1AQ7RTS3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PTF1AQ7RTS3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTF1AQ7RTS3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTF1AQ7RTS3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTF1AQ7RTS3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTF1AQ7RTS3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTF1AQ7RTS3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTF1AQ7RTS3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTF1AQ7RTS3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTF1AQ7RTS3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
PTF1AQ7RTS3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTF1AQ7RTS3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTF1AQ7RTS3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms