Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMUB2Q71RG4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms