Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINGO4Q6UY18 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINGO4Q6UY18 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINGO4Q6UY18 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms