Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXT8

ALKAL1, ALK and LTK ligand 1, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKAL1Q6UXT8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALKAL1Q6UXT8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALKAL1Q6UXT8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALKAL1Q6UXT8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALKAL1Q6UXT8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALKAL1Q6UXT8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALKAL1Q6UXT8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALKAL1Q6UXT8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALKAL1Q6UXT8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALKAL1Q6UXT8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ALKAL1Q6UXT8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ALKAL1Q6UXT8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALKAL1Q6UXT8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALKAL1Q6UXT8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALKAL1Q6UXT8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALKAL1Q6UXT8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALKAL1Q6UXT8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALKAL1Q6UXT8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALKAL1Q6UXT8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALKAL1Q6UXT8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALKAL1Q6UXT8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALKAL1Q6UXT8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALKAL1Q6UXT8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALKAL1Q6UXT8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ALKAL1Q6UXT8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ALKAL1Q6UXT8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ALKAL1Q6UXT8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALKAL1Q6UXT8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALKAL1Q6UXT8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALKAL1Q6UXT8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALKAL1Q6UXT8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALKAL1Q6UXT8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALKAL1Q6UXT8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALKAL1Q6UXT8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ALKAL1Q6UXT8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ALKAL1Q6UXT8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ALKAL1Q6UXT8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALKAL1Q6UXT8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALKAL1Q6UXT8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALKAL1Q6UXT8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALKAL1Q6UXT8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALKAL1Q6UXT8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALKAL1Q6UXT8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALKAL1Q6UXT8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALKAL1Q6UXT8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALKAL1Q6UXT8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALKAL1Q6UXT8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALKAL1Q6UXT8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms