Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWU4

C6orf89, Bombesin receptor-activated protein C6orf89, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf89Q6UWU4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C6orf89Q6UWU4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C6orf89Q6UWU4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C6orf89Q6UWU4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C6orf89Q6UWU4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C6orf89Q6UWU4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C6orf89Q6UWU4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C6orf89Q6UWU4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C6orf89Q6UWU4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C6orf89Q6UWU4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C6orf89Q6UWU4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C6orf89Q6UWU4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C6orf89Q6UWU4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C6orf89Q6UWU4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C6orf89Q6UWU4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C6orf89Q6UWU4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C6orf89Q6UWU4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C6orf89Q6UWU4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C6orf89Q6UWU4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C6orf89Q6UWU4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C6orf89Q6UWU4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C6orf89Q6UWU4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C6orf89Q6UWU4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C6orf89Q6UWU4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C6orf89Q6UWU4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C6orf89Q6UWU4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C6orf89Q6UWU4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C6orf89Q6UWU4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C6orf89Q6UWU4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C6orf89Q6UWU4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C6orf89Q6UWU4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C6orf89Q6UWU4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C6orf89Q6UWU4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C6orf89Q6UWU4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C6orf89Q6UWU4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C6orf89Q6UWU4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C6orf89Q6UWU4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C6orf89Q6UWU4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C6orf89Q6UWU4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C6orf89Q6UWU4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C6orf89Q6UWU4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C6orf89Q6UWU4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C6orf89Q6UWU4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C6orf89Q6UWU4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C6orf89Q6UWU4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C6orf89Q6UWU4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C6orf89Q6UWU4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms