Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP7

LCLAT1, Lysocardiolipin acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCLAT1Q6UWP7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCLAT1Q6UWP7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LCLAT1Q6UWP7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCLAT1Q6UWP7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCLAT1Q6UWP7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCLAT1Q6UWP7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCLAT1Q6UWP7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCLAT1Q6UWP7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCLAT1Q6UWP7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCLAT1Q6UWP7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCLAT1Q6UWP7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCLAT1Q6UWP7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCLAT1Q6UWP7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCLAT1Q6UWP7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCLAT1Q6UWP7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCLAT1Q6UWP7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCLAT1Q6UWP7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCLAT1Q6UWP7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCLAT1Q6UWP7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCLAT1Q6UWP7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCLAT1Q6UWP7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCLAT1Q6UWP7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCLAT1Q6UWP7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCLAT1Q6UWP7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCLAT1Q6UWP7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCLAT1Q6UWP7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCLAT1Q6UWP7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LCLAT1Q6UWP7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCLAT1Q6UWP7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCLAT1Q6UWP7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCLAT1Q6UWP7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCLAT1Q6UWP7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LCLAT1Q6UWP7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LCLAT1Q6UWP7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LCLAT1Q6UWP7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LCLAT1Q6UWP7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LCLAT1Q6UWP7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LCLAT1Q6UWP7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LCLAT1Q6UWP7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCLAT1Q6UWP7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LCLAT1Q6UWP7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCLAT1Q6UWP7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCLAT1Q6UWP7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCLAT1Q6UWP7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCLAT1Q6UWP7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCLAT1Q6UWP7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCLAT1Q6UWP7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCLAT1Q6UWP7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCLAT1Q6UWP7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCLAT1Q6UWP7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCLAT1Q6UWP7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCLAT1Q6UWP7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCLAT1Q6UWP7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCLAT1Q6UWP7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LCLAT1Q6UWP7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LCLAT1Q6UWP7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LCLAT1Q6UWP7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LCLAT1Q6UWP7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LCLAT1Q6UWP7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LCLAT1Q6UWP7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LCLAT1Q6UWP7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LCLAT1Q6UWP7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCLAT1Q6UWP7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCLAT1Q6UWP7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCLAT1Q6UWP7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCLAT1Q6UWP7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LCLAT1Q6UWP7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LCLAT1Q6UWP7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LCLAT1Q6UWP7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LCLAT1Q6UWP7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LCLAT1Q6UWP7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LCLAT1Q6UWP7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LCLAT1Q6UWP7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LCLAT1Q6UWP7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LCLAT1Q6UWP7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LCLAT1Q6UWP7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LCLAT1Q6UWP7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LCLAT1Q6UWP7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LCLAT1Q6UWP7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCLAT1Q6UWP7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCLAT1Q6UWP7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCLAT1Q6UWP7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCLAT1Q6UWP7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCLAT1Q6UWP7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCLAT1Q6UWP7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCLAT1Q6UWP7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCLAT1Q6UWP7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCLAT1Q6UWP7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCLAT1Q6UWP7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCLAT1Q6UWP7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCLAT1Q6UWP7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCLAT1Q6UWP7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LCLAT1Q6UWP7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LCLAT1Q6UWP7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LCLAT1Q6UWP7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LCLAT1Q6UWP7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LCLAT1Q6UWP7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LCLAT1Q6UWP7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LCLAT1Q6UWP7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LCLAT1Q6UWP7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms