Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
LRSAM1Q6UWE0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
LRSAM1Q6UWE0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRSAM1Q6UWE0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms