Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNIP4Q6PIL6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP4Q6PIL6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms