Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC27A1Q6PCB7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC27A1Q6PCB7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC27A1Q6PCB7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC27A1Q6PCB7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC27A1Q6PCB7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC27A1Q6PCB7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC27A1Q6PCB7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC27A1Q6PCB7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC27A1Q6PCB7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC27A1Q6PCB7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC27A1Q6PCB7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC27A1Q6PCB7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC27A1Q6PCB7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC27A1Q6PCB7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC27A1Q6PCB7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC27A1Q6PCB7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC27A1Q6PCB7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC27A1Q6PCB7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A1Q6PCB7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A1Q6PCB7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A1Q6PCB7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A1Q6PCB7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A1Q6PCB7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A1Q6PCB7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A1Q6PCB7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A1Q6PCB7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A1Q6PCB7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A1Q6PCB7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A1Q6PCB7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A1Q6PCB7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A1Q6PCB7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A1Q6PCB7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A1Q6PCB7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A1Q6PCB7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A1Q6PCB7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A1Q6PCB7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A1Q6PCB7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A1Q6PCB7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A1Q6PCB7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A1Q6PCB7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A1Q6PCB7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A1Q6PCB7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC27A1Q6PCB7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC27A1Q6PCB7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC27A1Q6PCB7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A1Q6PCB7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A1Q6PCB7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A1Q6PCB7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A1Q6PCB7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A1Q6PCB7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A1Q6PCB7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC27A1Q6PCB7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms