Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1R3

MSANTD2, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD2Q6P1R3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSANTD2Q6P1R3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSANTD2Q6P1R3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSANTD2Q6P1R3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSANTD2Q6P1R3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSANTD2Q6P1R3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSANTD2Q6P1R3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSANTD2Q6P1R3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSANTD2Q6P1R3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSANTD2Q6P1R3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSANTD2Q6P1R3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSANTD2Q6P1R3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MSANTD2Q6P1R3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms