Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms