Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDD2Q6NTF9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms