Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3CQ5T2N8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3CQ5T2N8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3CQ5T2N8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3CQ5T2N8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3CQ5T2N8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3CQ5T2N8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3CQ5T2N8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3CQ5T2N8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3CQ5T2N8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3CQ5T2N8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3CQ5T2N8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3CQ5T2N8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3CQ5T2N8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3CQ5T2N8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3CQ5T2N8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3CQ5T2N8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3CQ5T2N8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3CQ5T2N8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3CQ5T2N8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ATAD3CQ5T2N8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATAD3CQ5T2N8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms