Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV17

TMEM240, Transmembrane protein 240, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM240Q5SV17 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM240Q5SV17 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM240Q5SV17 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms