Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NBPF8Q3BBV2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NBPF8Q3BBV2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NBPF8Q3BBV2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NBPF8Q3BBV2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NBPF8Q3BBV2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NBPF8Q3BBV2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NBPF8Q3BBV2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NBPF8Q3BBV2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NBPF8Q3BBV2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
NBPF8Q3BBV2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NBPF8Q3BBV2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
NBPF8Q3BBV2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NBPF8Q3BBV2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NBPF8Q3BBV2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NBPF8Q3BBV2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NBPF8Q3BBV2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NBPF8Q3BBV2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NBPF8Q3BBV2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NBPF8Q3BBV2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NBPF8Q3BBV2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NBPF8Q3BBV2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NBPF8Q3BBV2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NBPF8Q3BBV2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NBPF8Q3BBV2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
NBPF8Q3BBV2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NBPF8Q3BBV2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NBPF8Q3BBV2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NBPF8Q3BBV2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NBPF8Q3BBV2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NBPF8Q3BBV2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NBPF8Q3BBV2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NBPF8Q3BBV2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NBPF8Q3BBV2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NBPF8Q3BBV2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NBPF8Q3BBV2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NBPF8Q3BBV2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NBPF8Q3BBV2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NBPF8Q3BBV2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NBPF8Q3BBV2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NBPF8Q3BBV2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
NBPF8Q3BBV2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
NBPF8Q3BBV2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NBPF8Q3BBV2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NBPF8Q3BBV2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NBPF8Q3BBV2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NBPF8Q3BBV2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
NBPF8Q3BBV2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NBPF8Q3BBV2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NBPF8Q3BBV2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NBPF8Q3BBV2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NBPF8Q3BBV2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NBPF8Q3BBV2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NBPF8Q3BBV2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NBPF8Q3BBV2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NBPF8Q3BBV2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NBPF8Q3BBV2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NBPF8Q3BBV2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NBPF8Q3BBV2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NBPF8Q3BBV2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NBPF8Q3BBV2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NBPF8Q3BBV2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NBPF8Q3BBV2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms