Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC142Q17RM4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC142Q17RM4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
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