Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM187BQ17R55 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM187BQ17R55 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM187BQ17R55 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM187BQ17R55 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM187BQ17R55 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM187BQ17R55 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM187BQ17R55 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM187BQ17R55 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM187BQ17R55 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM187BQ17R55 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM187BQ17R55 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM187BQ17R55 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM187BQ17R55 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM187BQ17R55 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM187BQ17R55 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM187BQ17R55 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM187BQ17R55 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM187BQ17R55 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM187BQ17R55 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM187BQ17R55 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM187BQ17R55 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM187BQ17R55 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms