Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RTN1Q16799 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RTN1Q16799 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RTN1Q16799 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RTN1Q16799 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RTN1Q16799 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RTN1Q16799 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTN1Q16799 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTN1Q16799 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RTN1Q16799 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTN1Q16799 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTN1Q16799 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTN1Q16799 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RTN1Q16799 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTN1Q16799 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTN1Q16799 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RTN1Q16799 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RTN1Q16799 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RTN1Q16799 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RTN1Q16799 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RTN1Q16799 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RTN1Q16799 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RTN1Q16799 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RTN1Q16799 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTN1Q16799 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RTN1Q16799 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTN1Q16799 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTN1Q16799 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RTN1Q16799 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RTN1Q16799 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RTN1Q16799 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RTN1Q16799 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RTN1Q16799 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RTN1Q16799 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RTN1Q16799 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RTN1Q16799 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RTN1Q16799 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTN1Q16799 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTN1Q16799 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTN1Q16799 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTN1Q16799 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RTN1Q16799 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RTN1Q16799 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RTN1Q16799 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RTN1Q16799 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RTN1Q16799 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RTN1Q16799 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RTN1Q16799 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RTN1Q16799 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
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