Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SNRNP35Q16560 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNRNP35Q16560 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNRNP35Q16560 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SNRNP35Q16560 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRNP35Q16560 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRNP35Q16560 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRNP35Q16560 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRNP35Q16560 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRNP35Q16560 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRNP35Q16560 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRNP35Q16560 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRNP35Q16560 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRNP35Q16560 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
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