Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL23Q16540 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms