Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PKN1Q16512 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKN1Q16512 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKN1Q16512 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKN1Q16512 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKN1Q16512 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKN1Q16512 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKN1Q16512 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKN1Q16512 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKN1Q16512 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKN1Q16512 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKN1Q16512 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PKN1Q16512 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKN1Q16512 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKN1Q16512 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKN1Q16512 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PKN1Q16512 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKN1Q16512 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKN1Q16512 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKN1Q16512 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKN1Q16512 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKN1Q16512 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKN1Q16512 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PKN1Q16512 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PKN1Q16512 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PKN1Q16512 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PKN1Q16512 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PKN1Q16512 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PKN1Q16512 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PKN1Q16512 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PKN1Q16512 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PKN1Q16512 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PKN1Q16512 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PKN1Q16512 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PKN1Q16512 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PKN1Q16512 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
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