Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CNGA3Q16281 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNGA3Q16281 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGA3Q16281 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms