Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
VAMP3Q15836 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP3Q15836 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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