Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ALX1Q15699 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ALX1Q15699 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
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