Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIP11Q15643 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIP11Q15643 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIP11Q15643 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIP11Q15643 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIP11Q15643 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIP11Q15643 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIP11Q15643 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIP11Q15643 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIP11Q15643 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIP11Q15643 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIP11Q15643 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIP11Q15643 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIP11Q15643 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIP11Q15643 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIP11Q15643 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIP11Q15643 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIP11Q15643 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIP11Q15643 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIP11Q15643 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIP11Q15643 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIP11Q15643 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIP11Q15643 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIP11Q15643 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIP11Q15643 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIP11Q15643 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIP11Q15643 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIP11Q15643 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIP11Q15643 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIP11Q15643 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIP11Q15643 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIP11Q15643 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIP11Q15643 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIP11Q15643 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIP11Q15643 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIP11Q15643 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIP11Q15643 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms