Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP1A4Q13733 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP1A4Q13733 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
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