Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CUL3Q13618 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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