Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PDE3BQ13370 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PDE3BQ13370 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PDE3BQ13370 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PDE3BQ13370 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PDE3BQ13370 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PDE3BQ13370 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PDE3BQ13370 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
PDE3BQ13370 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PDE3BQ13370 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PDE3BQ13370 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PDE3BQ13370 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PDE3BQ13370 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PDE3BQ13370 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PDE3BQ13370 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
PDE3BQ13370 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PDE3BQ13370 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PDE3BQ13370 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PDE3BQ13370 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PDE3BQ13370 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PDE3BQ13370 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
PDE3BQ13370 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PDE3BQ13370 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PDE3BQ13370 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PDE3BQ13370 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PDE3BQ13370 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PDE3BQ13370 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
PDE3BQ13370 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PDE3BQ13370 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PDE3BQ13370 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
PDE3BQ13370 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
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