Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 LPIN1-205ENST00000404113 4005 ntTSL 1 (best)9.08□□□□□ -0.962e-7■■■■■ 34.6
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TARDBPQ13148 LPIN1-210ENST00000454151 583 ntTSL 37.02□□□□□ -1.292e-7■■■■■ 34.6
TARDBPQ13148 CREB3L2-206ENST00000468127 596 ntTSL 322.01■■□□□ 1.114e-10■■■■■ 34.6
TARDBPQ13148 GRAP2-201ENST00000344138 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.722e-6■■■■■ 34.6
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TARDBPQ13148 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.419e-7■■■■■ 34.5
TARDBPQ13148 PIGS-201ENST00000268758 2397 ntTSL 211.31□□□□□ -0.69e-7■■■■■ 34.5
TARDBPQ13148 ALDH1A2-217ENST00000559517 1468 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.962e-6■■■■■ 34.5
TARDBPQ13148 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.262e-8■■■■■ 34.5
TARDBPQ13148 TGFBR3-210ENST00000533089 6455 ntTSL 1 (best)6.68□□□□□ -1.342e-8■■■■■ 34.5
TARDBPQ13148 FAM120A-203ENST00000427765 1710 ntTSL 1 (best)19.59■□□□□ 0.731e-19■■■■■ 34.5
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TARDBPQ13148 ZNF383-202ENST00000585441 562 ntTSL 518.3■□□□□ 0.524e-10■■■■■ 34.4
TARDBPQ13148 ZNF383-203ENST00000586068 2241 ntTSL 216.74■□□□□ 0.274e-10■■■■■ 34.4
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TARDBPQ13148 ZNF383-208ENST00000590503 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.14e-10■■■■■ 34.4
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TARDBPQ13148 RAB31-210ENST00000581109 469 ntTSL 323.85■■□□□ 1.419e-7■■■■■ 34.4
TARDBPQ13148 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.139e-7■■■■■ 34.4
TARDBPQ13148 RAB31-201ENST00000435762 518 ntTSL 38.75□□□□□ -1.019e-7■■■■■ 34.4
TARDBPQ13148 RAB31-212ENST00000583921 583 ntTSL 48.6□□□□□ -1.039e-7■■■■■ 34.4
TARDBPQ13148 RAB31-203ENST00000577371 272 ntTSL 33.92□□□□□ -1.789e-7■■■■■ 34.4
TARDBPQ13148 RAB31-204ENST00000577796 295 ntTSL 32.9□□□□□ -1.959e-7■■■■■ 34.4
TARDBPQ13148 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.131e-13■■■■■ 34.4
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TARDBPQ13148 ADARB1-203ENST00000389861 5031 ntTSL 1 (best)20.75■□□□□ 0.911e-7■■■■■ 34.4
TARDBPQ13148 ADARB1-212ENST00000496664 5033 ntTSL 1 (best)20.75■□□□□ 0.911e-7■■■■■ 34.4
TARDBPQ13148 ADARB1-211ENST00000492414 4913 ntTSL 1 (best)19.81■□□□□ 0.761e-7■■■■■ 34.4
TARDBPQ13148 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.481e-7■■■■■ 34.4
TARDBPQ13148 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 34.4
TARDBPQ13148 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.486e-7■■■■■ 34.3
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TARDBPQ13148 TSN-209ENST00000490717 560 ntTSL 416.46■□□□□ 0.231e-8■■■■■ 34.3
TARDBPQ13148 TSN-205ENST00000478165 578 ntTSL 316.46■□□□□ 0.231e-8■■■■■ 34.3
TARDBPQ13148 TSN-203ENST00000455432 555 ntTSL 414.95□□□□□ -0.021e-8■■■■■ 34.3
TARDBPQ13148 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.281e-8■■■■■ 34.3
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TARDBPQ13148 TSN-210ENST00000495112 605 ntTSL 48.45□□□□□ -1.061e-8■■■■■ 34.3
TARDBPQ13148 ADARB1-207ENST00000460734 2523 ntTSL 1 (best)23.29■■□□□ 1.321e-7■■■■■ 34.3
TARDBPQ13148 UBE3A-210ENST00000626068 772 ntTSL 24.77□□□□□ -1.656e-10■■■■■ 34.3
TARDBPQ13148 EPC2-202ENST00000397424 672 ntTSL 319.27■□□□□ 0.687e-10■■■■■ 34.2
TARDBPQ13148 EPC2-205ENST00000457184 724 ntTSL 519.23■□□□□ 0.677e-10■■■■■ 34.2
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TARDBPQ13148 ADGRE5-209ENST00000587728 587 ntTSL 49.97□□□□□ -0.817e-10■■■■■ 34.2
TARDBPQ13148 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.537e-10■■■■■ 34.2
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TARDBPQ13148 PGRMC2-202ENST00000394276 2858 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.221e-9■■■■■ 34.2
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TARDBPQ13148 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.289e-7■■■■■ 34.1
TARDBPQ13148 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.396e-8■■■■■ 34.1
TARDBPQ13148 ABCC4-207ENST00000629385 2903 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.446e-8■■■■■ 34.1
TARDBPQ13148 ABCC4-201ENST00000376887 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.216e-8■■■■■ 34.1
TARDBPQ13148 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.065e-7■■■■■ 34
TARDBPQ13148 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.71e-10■■■■■ 34
TARDBPQ13148 TNIP1-207ENST00000520695 658 ntTSL 419.09■□□□□ 0.651e-10■■■■■ 34
TARDBPQ13148 TNIP1-216ENST00000522926 464 ntTSL 319.09■□□□□ 0.651e-10■■■■■ 34
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TARDBPQ13148 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.251e-10■■■■■ 34
TARDBPQ13148 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.231e-10■■■■■ 34
TARDBPQ13148 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.171e-10■■■■■ 34
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TARDBPQ13148 TNIP1-218ENST00000523338 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.511e-10■■■■■ 34
TARDBPQ13148 TNIP1-209ENST00000521001 575 ntTSL 49.76□□□□□ -0.851e-10■■■■■ 34
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TARDBPQ13148 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.87e-16■■■■■ 34
TARDBPQ13148 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.427e-16■■■■■ 34
TARDBPQ13148 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.317e-16■■■■■ 34
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