Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXF1Q12946 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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