Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPN13Q12923 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPN13Q12923 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN13Q12923 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN13Q12923 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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