Protein–RNA interactions for Protein: Q12460

NOP56, Nucleolar protein 56, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP56Q12460 ADE13YLR359W 1449 nt5.82□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 STT3YGL022W 2157 nt5.82□□□□□ -1.48 RIP-Chip
NOP56Q12460 MET7YOR241W 1647 nt5.81□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 PRT1YOR361C 2292 nt5.81□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.81□□□□□ -1.48 RIP-Chip
NOP56Q12460 PEX19YDL065C 1029 nt5.81□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 MOB2YFL034C-B 864 nt5.81□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 PRE3YJL001W 648 nt5.81□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 HOC1YJR075W 1191 nt5.81□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 KSH1YNL024C-A 219 nt5.81□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 COQ3YOL096C 939 nt5.81□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 SPE3YPR069C 882 nt5.81□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 GSH2YOL049W 1476 nt5.81□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 ASF2YDL197C 1578 nt5.8□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 YHL017WYHL017W 1599 nt5.8□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 TOS3YGL179C 1683 nt5.8□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 RMD1YDL001W 1293 nt5.8□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 MAF1YDR005C 1188 nt5.8□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 ECT1YGR007W 972 nt5.8□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 YGR273CYGR273C 525 nt5.8□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 YHL045WYHL045W 348 nt5.8□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 LIA1YJR070C 978 nt5.8□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 UIP3YAR027W 708 nt5.8□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 BSC4YNL269W 396 nt5.8□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 PSH1YOL054W 1221 nt5.8□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt5.8□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 TUP1YCR084C 2142 nt5.8□□□□□ -1.48 RIP-Chip
NOP56Q12460 DOT1YDR440W 1749 nt5.79□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 PGM1YKL127W 1713 nt5.79□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 TFG1YGR186W 2208 nt5.79□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 VCX1YDL128W 1236 nt5.79□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 ARD1YHR013C 717 nt5.79□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 SED5YLR026C 1023 nt5.79□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt5.79□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 VPS28YPL065W 729 nt5.79□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 YME1YPR024W 2244 nt5.79□□□□□ -1.48 RIP-Chip
NOP56Q12460 SNF3YDL194W 2655 nt5.78□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 STE20YHL007C 2820 nt5.78□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 SAY1YGR263C 1275 nt5.78□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 YRB2YIL063C 984 nt5.78□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 RPR2YIR015W 435 nt5.78□□□□□ -1.48 RIP-Chip
NOP56Q12460 YJR056CYJR056C 711 nt5.78□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 AIM24YJR080C 1185 nt5.78□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 COS10YNR075W 1125 nt5.78□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 YPL257WYPL257W 582 nt5.78□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 ISA2YPR067W 558 nt5.78□□□□□ -1.48
NOP56Q12460 ATG1YGL180W 2694 nt5.77□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 FAL1YDR021W 1200 nt5.77□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 YDR249CYDR249C 1122 nt5.77□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 ASF1YJL115W 840 nt5.77□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 YJR146WYJR146W 354 nt5.77□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 YKL077WYKL077W 1179 nt5.77□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 LDB7YBL006C 543 nt5.77□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt5.77□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 TUL1YKL034W 2277 nt5.77□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 MSY1YPL097W 1479 nt5.77□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 PLB3YOL011W 2061 nt5.76□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 BIO3YNR058W 1443 nt5.76□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 YIL067CYIL067C 2037 nt5.76□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 FMO1YHR176W 1299 nt5.76□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 RUF23RUF23 254 nt5.76□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 MRL1YPR079W 1146 nt5.76□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 VNX1YNL321W 2727 nt5.76□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 CCC2YDR270W 3015 nt5.75□□□□□ -1.49 RIP-Chip
NOP56Q12460 SEC9YGR009C 1956 nt5.75□□□□□ -1.49 RIP-Chip
NOP56Q12460 AFT1YGL071W 2073 nt5.75□□□□□ -1.49 RIP-Chip
NOP56Q12460 PGK1YCR012W 1251 nt5.75□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 YFR035CYFR035C 345 nt5.75□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 YNG2YHR090C 849 nt5.75□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt5.75□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 YAR064WYAR064W 300 nt5.75□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 MID2YLR332W 1131 nt5.75□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt5.75□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 YGR054WYGR054W 1929 nt5.75□□□□□ -1.49 RIP-Chip
NOP56Q12460 NOC4YPR144C 1659 nt5.75□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 YHR182WYHR182W 2358 nt5.74□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 MPH3YJR160C 1809 nt5.74□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 GPD1YDL022W 1176 nt5.74□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 VMA3YEL027W 483 nt5.74□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 SPO16YHR153C 597 nt5.74□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 MHO1YJR008W 1017 nt5.74□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 YLL059CYLL059C 507 nt5.74□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 RPS31YLR167W 459 nt5.74□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 YLR312CYLR312C 1197 nt5.74□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 BLS1YLR408C 369 nt5.74□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 YNL120CYNL120C 486 nt5.74□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 MRPL23YOR150W 492 nt5.74□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 UTP18YJL069C 1785 nt5.74□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 YPK3YBR028C 1578 nt5.73□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 KCH1YJR054W 1494 nt5.73□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 SCL1YGL011C 759 nt5.73□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 PDE1YGL248W 1110 nt5.73□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 POR2YIL114C 846 nt5.73□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 LYS1YIR034C 1122 nt5.73□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 YOL163WYOL163W 510 nt5.73□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 FSF1YOR271C 984 nt5.73□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 ADE6YGR061C 4077 nt5.73□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 CRH1YGR189C 1524 nt5.73□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 GRX6YDL010W 696 nt5.72□□□□□ -1.49
NOP56Q12460 CHO1YER026C 831 nt5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 77 ms