Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 HSP78YDR258C 2436 nt5.52□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 YDR015CYDR015C 240 nt5.52□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 HVG1YER039C 750 nt5.52□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 HAP2YGL237C 798 nt5.52□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 SRY1YKL218C 981 nt5.52□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 SEC13YLR208W 894 nt5.52□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 GRE1YPL223C 507 nt5.52□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 YEF1YEL041W 1488 nt5.51□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 HPF1YOL155C 2904 nt5.51□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 UGX2YDL169C 672 nt5.51□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.51□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 RME1YGR044C 903 nt5.51□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 YHL018WYHL018W 363 nt5.51□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt5.51□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 RFA2YNL312W 822 nt5.51□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 RAD24YER173W 1980 nt5.51□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 CDC4YFL009W 2340 nt5.51□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 CLA4YNL298W 2529 nt5.5□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 FRE7YOL152W 1863 nt5.5□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 ATG1YGL180W 2694 nt5.5□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 RTT103YDR289C 1230 nt5.5□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 MDH1YKL085W 1005 nt5.5□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 JNM1YMR294W 1122 nt5.5□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 FSF1YOR271C 984 nt5.5□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 YPK2YMR104C 2034 nt5.5□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 MEC3YLR288C 1425 nt5.49□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 NGR1YBR212W 2019 nt5.49□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 HMLALPHA1YCL066W 528 nt5.49□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 MATALPHA1YCR040W 528 nt5.49□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 RSM10YDR041W 612 nt5.49□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 RPS2YGL123W 765 nt5.49□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 SIP2YGL208W 1248 nt5.49□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 MTF1YMR228W 1026 nt5.49□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 YMR295CYMR295C 594 nt5.49□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 YNL285WYNL285W 372 nt5.49□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 STE12YHR084W 2067 nt5.49□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 TRK2YKR050W 2670 nt5.49□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 DIA3YDL024C 1407 nt5.48□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 FAA4YMR246W 2085 nt5.48□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 LCB2YDR062W 1686 nt5.48□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 YDL218WYDL218W 954 nt5.48□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 YER186CYER186C 921 nt5.48□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 DRE2YKR071C 1047 nt5.48□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 MRPL15YLR312W-A 762 nt5.48□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 RPN7YPR108W 1290 nt5.48□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 NUP116YMR047C 3342 nt5.48□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 YEH1YLL012W 1722 nt5.48□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 YTA12YMR089C 2478 nt5.48□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 RPT1YKL145W 1404 nt5.48□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 VHS2YIL135C 1311 nt5.48□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 YJR124CYJR124C 1347 nt5.48□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 SYG1YIL047C 2709 nt5.47□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 MOT2YER068W 1764 nt5.47□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 OPI7YDR360W 435 nt5.47□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 ZRT1YGL255W 1131 nt5.47□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 DJP1YIR004W 1299 nt5.47□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.47□□□□□ -1.53
NFI1Q12216 RRP9YPR137W 1722 nt5.46□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 SLD2YKL108W 1362 nt5.46□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 CLB4YLR210W 1383 nt5.46□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 HST4YDR191W 1113 nt5.46□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 PMP3YDR276C 168 nt5.46□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 SCS2YER120W 735 nt5.46□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.46□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.46□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.46□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 RRT7YLL030C 342 nt5.46□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.46□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 SOL1YNR034W 966 nt5.46□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 CSG2YBR036C 1233 nt5.46□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 DSF1YEL070W 1509 nt5.46□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 YNR073CYNR073C 1509 nt5.46□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 SFI1YLL003W 2841 nt5.46□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 FUM1YPL262W 1467 nt5.45□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 PCA1YBR295W 3651 nt5.45□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 CDS1YBR029C 1374 nt5.45□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 CLF1YLR117C 2064 nt5.45□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 RHO2YNL090W 579 nt5.45□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 SIF2YBR103W 1608 nt5.45□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 TDA7YNL176C 1911 nt5.44□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 RAD16YBR114W 2373 nt5.44□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 YDR109CYDR109C 2148 nt5.44□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 APL6YGR261C 2430 nt5.44□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 COS6YGR295C 1146 nt5.44□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 RPS5YJR123W 678 nt5.44□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 SFK1YKL051W 1062 nt5.44□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 STM1YLR150W 822 nt5.44□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 FAA3YIL009W 2085 nt5.44□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 APE3YBR286W 1614 nt5.44□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 YDL057WYDL057W 987 nt5.43□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 LUC7YDL087C 786 nt5.43□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 CIN4YMR138W 576 nt5.43□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 ARN1YHL040C 1884 nt5.43□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 PDI1YCL043C 1569 nt5.42□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 KSS1YGR040W 1107 nt5.42□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 DOT5YIL010W 648 nt5.42□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 ECM1YAL059W 639 nt5.42□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 TAF11YML015C 1041 nt5.42□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 YML018CYML018C 1182 nt5.42□□□□□ -1.54
NFI1Q12216 TOM40YMR203W 1164 nt5.42□□□□□ -1.54
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