Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSC1Q08554 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSC1Q08554 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSC1Q08554 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.4 ms