Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TNK2Q07912 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms