Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPEQ02224 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPEQ02224 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPEQ02224 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms