Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1BQ00975 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1BQ00975 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms