Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDLBPQ00341 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDLBPQ00341 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDLBPQ00341 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDLBPQ00341 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDLBPQ00341 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDLBPQ00341 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDLBPQ00341 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDLBPQ00341 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDLBPQ00341 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HDLBPQ00341 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HDLBPQ00341 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HDLBPQ00341 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDLBPQ00341 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDLBPQ00341 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDLBPQ00341 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDLBPQ00341 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDLBPQ00341 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDLBPQ00341 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HDLBPQ00341 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDLBPQ00341 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDLBPQ00341 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDLBPQ00341 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDLBPQ00341 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDLBPQ00341 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDLBPQ00341 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDLBPQ00341 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDLBPQ00341 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDLBPQ00341 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDLBPQ00341 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HDLBPQ00341 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HDLBPQ00341 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HDLBPQ00341 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HDLBPQ00341 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HDLBPQ00341 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HDLBPQ00341 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HDLBPQ00341 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HDLBPQ00341 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HDLBPQ00341 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HDLBPQ00341 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HDLBPQ00341 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HDLBPQ00341 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HDLBPQ00341 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HDLBPQ00341 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HDLBPQ00341 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HDLBPQ00341 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HDLBPQ00341 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HDLBPQ00341 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDLBPQ00341 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDLBPQ00341 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDLBPQ00341 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDLBPQ00341 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
HDLBPQ00341 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDLBPQ00341 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDLBPQ00341 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDLBPQ00341 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDLBPQ00341 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDLBPQ00341 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDLBPQ00341 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDLBPQ00341 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDLBPQ00341 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDLBPQ00341 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDLBPQ00341 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDLBPQ00341 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDLBPQ00341 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
HDLBPQ00341 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDLBPQ00341 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDLBPQ00341 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDLBPQ00341 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDLBPQ00341 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDLBPQ00341 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDLBPQ00341 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDLBPQ00341 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDLBPQ00341 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDLBPQ00341 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms