Protein–RNA interactions for Protein: P78324

SIRPA, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPAP78324 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRPAP78324 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms