Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HBBP68871 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HBBP68871 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HBBP68871 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HBBP68871 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HBBP68871 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HBBP68871 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HBBP68871 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HBBP68871 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HBBP68871 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HBBP68871 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HBBP68871 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HBBP68871 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HBBP68871 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HBBP68871 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HBBP68871 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HBBP68871 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HBBP68871 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HBBP68871 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HBBP68871 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HBBP68871 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HBBP68871 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HBBP68871 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HBBP68871 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HBBP68871 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HBBP68871 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HBBP68871 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HBBP68871 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HBBP68871 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HBBP68871 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HBBP68871 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HBBP68871 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HBBP68871 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HBBP68871 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HBBP68871 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HBBP68871 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HBBP68871 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HBBP68871 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HBBP68871 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HBBP68871 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HBBP68871 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HBBP68871 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HBBP68871 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HBBP68871 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HBBP68871 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HBBP68871 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HBBP68871 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HBBP68871 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HBBP68871 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HBBP68871 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HBBP68871 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HBBP68871 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HBBP68871 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HBBP68871 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HBBP68871 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HBBP68871 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HBBP68871 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HBBP68871 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HBBP68871 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HBBP68871 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HBBP68871 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HBBP68871 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HBBP68871 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HBBP68871 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HBBP68871 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HBBP68871 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HBBP68871 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HBBP68871 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HBBP68871 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HBBP68871 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HBBP68871 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HBBP68871 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HBBP68871 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HBBP68871 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HBBP68871 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HBBP68871 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBBP68871 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBBP68871 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBBP68871 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBBP68871 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBBP68871 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBBP68871 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBBP68871 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBBP68871 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBBP68871 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBBP68871 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBBP68871 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBBP68871 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBBP68871 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBBP68871 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBBP68871 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBBP68871 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HBBP68871 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HBBP68871 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HBBP68871 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HBBP68871 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HBBP68871 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HBBP68871 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HBBP68871 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HBBP68871 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms