Protein–RNA interactions for Protein: P57082

TBX4, T-box transcription factor TBX4, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX4P57082 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBX4P57082 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBX4P57082 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBX4P57082 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBX4P57082 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBX4P57082 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBX4P57082 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBX4P57082 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBX4P57082 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TBX4P57082 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TBX4P57082 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TBX4P57082 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TBX4P57082 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TBX4P57082 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TBX4P57082 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TBX4P57082 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TBX4P57082 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TBX4P57082 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TBX4P57082 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TBX4P57082 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TBX4P57082 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TBX4P57082 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TBX4P57082 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TBX4P57082 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TBX4P57082 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TBX4P57082 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TBX4P57082 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TBX4P57082 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TBX4P57082 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TBX4P57082 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TBX4P57082 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TBX4P57082 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TBX4P57082 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TBX4P57082 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TBX4P57082 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TBX4P57082 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TBX4P57082 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TBX4P57082 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TBX4P57082 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TBX4P57082 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TBX4P57082 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TBX4P57082 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TBX4P57082 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TBX4P57082 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TBX4P57082 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TBX4P57082 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TBX4P57082 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TBX4P57082 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBX4P57082 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TBX4P57082 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBX4P57082 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TBX4P57082 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBX4P57082 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBX4P57082 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TBX4P57082 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBX4P57082 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBX4P57082 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBX4P57082 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBX4P57082 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TBX4P57082 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TBX4P57082 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TBX4P57082 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TBX4P57082 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TBX4P57082 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TBX4P57082 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TBX4P57082 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TBX4P57082 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TBX4P57082 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TBX4P57082 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TBX4P57082 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TBX4P57082 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TBX4P57082 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TBX4P57082 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TBX4P57082 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TBX4P57082 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TBX4P57082 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TBX4P57082 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TBX4P57082 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TBX4P57082 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TBX4P57082 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TBX4P57082 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TBX4P57082 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TBX4P57082 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TBX4P57082 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TBX4P57082 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TBX4P57082 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TBX4P57082 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TBX4P57082 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TBX4P57082 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TBX4P57082 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TBX4P57082 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TBX4P57082 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TBX4P57082 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TBX4P57082 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TBX4P57082 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TBX4P57082 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TBX4P57082 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TBX4P57082 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TBX4P57082 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TBX4P57082 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms