Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HADHBP55084 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HADHBP55084 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HADHBP55084 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HADHBP55084 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HADHBP55084 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HADHBP55084 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HADHBP55084 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HADHBP55084 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HADHBP55084 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HADHBP55084 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HADHBP55084 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HADHBP55084 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HADHBP55084 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HADHBP55084 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HADHBP55084 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HADHBP55084 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HADHBP55084 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HADHBP55084 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HADHBP55084 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HADHBP55084 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HADHBP55084 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HADHBP55084 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HADHBP55084 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HADHBP55084 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HADHBP55084 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HADHBP55084 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HADHBP55084 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HADHBP55084 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HADHBP55084 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HADHBP55084 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HADHBP55084 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HADHBP55084 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HADHBP55084 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HADHBP55084 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HADHBP55084 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HADHBP55084 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HADHBP55084 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HADHBP55084 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HADHBP55084 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HADHBP55084 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HADHBP55084 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HADHBP55084 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HADHBP55084 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HADHBP55084 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HADHBP55084 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HADHBP55084 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HADHBP55084 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HADHBP55084 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HADHBP55084 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HADHBP55084 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HADHBP55084 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HADHBP55084 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HADHBP55084 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HADHBP55084 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HADHBP55084 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HADHBP55084 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HADHBP55084 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HADHBP55084 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HADHBP55084 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HADHBP55084 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HADHBP55084 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HADHBP55084 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HADHBP55084 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HADHBP55084 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HADHBP55084 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HADHBP55084 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HADHBP55084 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HADHBP55084 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HADHBP55084 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HADHBP55084 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HADHBP55084 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HADHBP55084 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HADHBP55084 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HADHBP55084 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HADHBP55084 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HADHBP55084 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HADHBP55084 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HADHBP55084 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HADHBP55084 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HADHBP55084 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HADHBP55084 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HADHBP55084 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HADHBP55084 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HADHBP55084 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HADHBP55084 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HADHBP55084 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HADHBP55084 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HADHBP55084 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HADHBP55084 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HADHBP55084 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HADHBP55084 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HADHBP55084 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HADHBP55084 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HADHBP55084 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HADHBP55084 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HADHBP55084 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HADHBP55084 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HADHBP55084 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HADHBP55084 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms